Třeboň leží v Jižních Čechách, jihozápadním směrem od města Jindřichův Hradec. Město se rozkládá ve středu chráněné krajinné oblasti Třeboňsko, která se vyznačuje velkým množstvím rozlehlých rybníků. Třeboň je i oblíbeným lázeňským střediskem. Návštěvníci využívají léčebné účinky zdejší rašeliny.