Obec Malenice sa nachádza v okrese Strakonice, kraj Juhočeský, pri rieke Volyňke zhruba 4,5 km južne od Volyne a 15 km južne od Strakoníc.
Obcou prechádza železničná trať 198, spájajúca Strakonice, Vimperk a Volary, na ktorej je situovaná železničná zastávka Malenice nad Volyňkou. Žije tu 707 obyvateľov.