Na místě, kde se v současnosti nachází klášter Jerónimos, vedle staré belémské pláže, původně stávala malá poustevna zasvěcená svaté Marii, kterou nechal postavit Infante D. Henrique v roce 1452. Na počátku 16. král Manuel I. viděl jeho záměr nařídit tam postavit velký klášter uznaný Svatým stolcem, který byl darován řádu bratří svatého Jeronýma.
Tento klášter, vrchol manuelské architektury a neodmyslitelně spojený s eposem Objevů, je nejpozoruhodnějším portugalským klášterním komplexem své doby a jedním z hlavních sálových kostelů v Evropě.
Stavba začala v roce 1501, trvala sto let a řídila ji významná skupina domácích i zahraničních architektů a stavitelů. S počáteční úpravou Francouze Boytaca pokračovali v práci další mistři, zejména João de Castilho a již v polovině století Diogo de Torralva. Po příchodu Portugalců do Indie byla portugalská koruna schopna projekt financovat prostředky z obchodu s Východem. Král Manuel I. nasměroval značnou část takzvané „Pepřové dvacítky“ (přibližně 5 % příjmů z obchodu s Afrikou a Východem, což odpovídá 70 kg zlata ročně) na financování stavebních prací.
V této památce, prohlášené za světové dědictví UNESCO, si fasády, kostel a ambity zaslouží zvláštní zmínku. Na jižní fasádě můžete obdivovat portál od João de Castilho, ve kterém jsou postavy uspořádány podle specifické hierarchie: dole Infante D. Henrique střeží vchod, uprostřed žehná Panna Maria Belémská pomník a archanděl svatý Gabriel, ochránce Portugalska, dokončuje oblouk. Západní portál, kterým vstupujete do posvátného prostoru, je výtvorem Nicolau Chanterenne. Vlevo, chráněná svatým Jeronýmem, je socha krále Manuela, která je považována za věrný portrét, a vpravo socha královny Marie, jeho manželky, chráněné svatým Janem Křtitelem.
Uvnitř můžete vidět kostelní síň, manuelské mistrovské dílo, stvoření João de Castillo. Všimněte si, jak v odvážném architektonickém díle není nádherná klenba příčné lodi podepřena žádnými sloupy. U vchodu po nízkém chóru jsou kenotafy básníka Luíse de Camões, autora epické básně Os Lusíadas, a Vasca da Gamy, vrchního velitele námořnictva, které v roce 1497 vyplulo do Indie. V kaplích Po stranách jsou pohřbeni králové, princové a nemluvňata pocházející z Manuela I. V hlavní kapli, kterou později zrekonstruoval Jerónimo de Ruão, jsou hrobky krále Manuela I., jeho syna Juana III. a jejich manželek. Zvláštní zmínku si zaslouží masivní stříbrný svatostánek, dílo portugalského zlatnictví z poloviny 17. století.